Identifikační klíče jsou datové struktury zajišťující vstup do příslušných databází, a tím i k dalším informacím. Nejfrekventovanějšími a nejdůležitějšími klíči jsou bezesporu GTIN, GLN a SSCC. Dalšími důležitými klíči, již však méně frekventovanými, jsou např. GDTI, GRAI, GSRN, GSIN, GIAI, GINC a je připravován GCN. Podrobnější informace naleznete v sekci „Čárové kódy a identifikace“.